Capítulo 2 Introducción
En este libro-tutorial realizaremos simulaciones de datos para modelos de ocupación, bajo el modelo estático de una sola estación, desarrollado originalmente por Daryl MacKenzie (MacKenzie et al., 2002). El modelo básico de ocupación, es la piedra angular del muestreo y monitoreo biológico moderno!.
El objetivo de este documento es entender la versatilidad y el poder de las simulaciones con R en el capítulo 3. Aprenderemos el principio biologico y el mecanismo bajo el cual funciona el modelo básico de ocupación en el capítulo 4. Realizaremos un ejemplo sencillo en el capítulo 5 para un venado del Parque Nacional Machalilla. Posteriormente empacaremos el código que genera los datos de ocupación, en una sola función en el Capítulo 6. Esta función nos permitirá simular datos bajo diferentes escenarios, los cuales analizaremos con los estimadores de máxima verosimilitud de la función occu del paquete unmarked en el Capítulo 7. Posteriormente analizaremos los mismos datos bajo estimadores bayesianos en el Capítulo 8, para al final comparar la precisión de ambas aproximaciones, máxima verosimilitud y bayesiana.
References
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MacKenzie, D. I., Nichols, J. D., Lachman, G. B., Droege, S., Andrew Royle, J., & Langtimm, C. A. (2002). Estimating site occupancy rates when detection probabilities are less than one. Ecology, 83(8), 2248–2255. doi: 10.1890/0012-9658(2002)083[2248:ESORWD]2.0.CO;2