Modelado de la Ocupación, abundancia y densidad de poblaciones: enfoque frecuentista y bayesiano en R. Modelo de ocupación de multiples temporadas

Diego Lizcano

Repaso del concepto de ocupación

Repaso del concepto de ocupación y las matemáticas detras del modelo

Author

Diego Lizcano

Published

June 24, 2025

Antes de comenzar

Datos y organización general

En primer lugar, es importante recordar que la organización es clave cuando se está generando un nuevo código. En este sentido, le recomendamos que cree una carpeta en su disco duro (C:) para cada nuevo proyecto. Puede hacer esto como un proyecto de Rstudio; para esto diríjase a: Archivo> Nuevo proyecto o simplemente cree una nueva carpeta en su explorador y establezca su directorio de trabajo allí. Dentro de esta carpeta, cree una carpeta de datos donde guardará sus datos sin procesar. Puede almacenar algunos objetos intermedios en otra subcarpeta. También cree una carpeta para su código R y una carpeta para guardar sus figuras.

la organización de carpetas que se sugere es:

C://curso
- data
- R
- fig

Objetivo

Presentar una introducción a los conceptos de monitoreo de biodiversidad usando modelos de ocupación, con estimadores de máxima verosimilitud y bayesianos.

Prerrequisitos

Conocimientos de estadística básica (probabilidad y regresiones), manejo básico de R (objetos, vectores, data frame, matrices y funciones). Es importante que los participantes estén familiarizados con R.

Introducción (Teórico, 1 horas)

El problema de contar organismos en ecología, censos, muestreos, poblaciones y tamaño poblacional. La densidad, la abundancia y la ocupación.

Tenga en cuenta que se requiere conexión a internet y que podemos estar descargando algunos datos desde GitHub…

Presentación

Package Citation

Code

pkgs <- cite_packages(output = "paragraph", pkgs="Session", out.dir = ".")
# knitr::kable(pkgs)
pkgs

We used R version 4.4.2 (R Core Team 2024) and the following R packages: .

Sesion info

Note

print(sessionInfo(), locale = FALSE)

R version 4.4.2 (2024-10-31 ucrt)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64
Running under: Windows 10 x64 (build 19045)

Matrix products: default


attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] grateful_0.2.10

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] htmlwidgets_1.6.4 compiler_4.4.2    fastmap_1.2.0     cli_3.6.3        
 [5] tools_4.4.2       htmltools_0.5.8.1 rstudioapi_0.17.1 yaml_2.3.10      
 [9] rmarkdown_2.29    knitr_1.49        jsonlite_1.8.9    xfun_0.49        
[13] digest_0.6.37     rlang_1.1.4       evaluate_1.0.1

References

R Core Team. 2024. R: A Language and Environment for Statistical Computing. Vienna, Austria: R Foundation for Statistical Computing. https://www.R-project.org/.

Reuse

CC BY-SA 4.0

Citation

BibTeX citation:

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    Poblaciones: Enfoque Frecuentista y Bayesiano En {R.} {Modelo} de
    Ocupación de Multiples Temporadas},
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}

For attribution, please cite this work as:

Lizcano, Diego. 2025. “Modelado de La Ocupación, Abundancia y Densidad de Poblaciones: Enfoque Frecuentista y Bayesiano En R. Modelo de Ocupación de Multiples Temporadas.” June 24, 2025. https://dlizcano.github.io/occu_multi_season/.